CEA/DSV/IBeB/SBVME/LEMiRE - P2TF Database - Version 2.9
 

Genomes

Species search
Taxonomy tree-browser
Organism Lineage Transcription Factor misPredicted TF protein
Escherichia blattae DSM 4481 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 261 3
Escherichia coli O7:K1 str. CE10 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 321 12
Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10C Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10D Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 288 1
Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 12 0
Escherichia coli P12b Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 284 12
Escherichia coli SE15 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 301 3
Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 4 0
Escherichia coli E24377A Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 298 10
Escherichia coli UM146 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 294 11
Escherichia coli UM146 plasmid pUM146 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli UMNK88 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 304 12
Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 2
Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 1
Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 1
Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 13 1
Escherichia coli W Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 299 1
Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 4 0
Escherichia coli W plasmid pRK1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli W Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 300 0
Escherichia coli W plasmid pRK1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli Xuzhou21 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 308 9
Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157_Sal Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli APEC O78 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 297 1
Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 253 3
Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 328 2
Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 4 0
Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pG-09EL50 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 327 3
Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pG-09EL71 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 328 4
Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli JJ1886 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 311 7
Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 4 0
Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 6 0
Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli LY180 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 292 1
Escherichia coli PMV-1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 294 5
Escherichia coli PMV-1 plasmid pHUSEC411like Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 5 0
Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 2
Escherichia coli ED1a Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 290 3
Escherichia coli HS Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 278 3
Escherichia coli IAI1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 287 0
Escherichia coli 55989 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 313 2
Escherichia coli IAI39 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 303 5
Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 287 8
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 293 1
Escherichia coli O103:H2 str. 12009 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 321 3
Escherichia coli O111:H- str. 11128 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 312 1
Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 5 2
Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli BL21-Gold(DE3)pLysS AG Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 272 7
Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 295 5
Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 4 0
Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 305 10
Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli O157:H7 str. EDL933 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 307 5
Escherichia coli O157:H7 str. EDL933 plasmid pO157 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli O157:H7 str. Sakai Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 317 8
Escherichia coli APEC O1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 297 18
Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 322 3
Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli O26:H11 str. 11368 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 330 0
Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 5 0
Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 317 4
Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 6 2
Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 1
Escherichia coli S88 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 306 3
Escherichia coli S88 plasmid pECOS88 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 1
Escherichia coli SE11 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 303 1
Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 1
Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 2
Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 1
Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 8 0
Escherichia coli SMS-3-5 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 311 6
Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 5 0
Escherichia coli UMN026 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 312 2
Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 8 0
Escherichia coli UMN026 plasmid p2ESCUM Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli UTI89 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 306 10
Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 1
Escherichia coli ATCC 8739 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 297 1
Escherichia coli 042 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 315 5
Escherichia coli 042 plasmid pAA Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli str. clone D i14 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 298 10
Escherichia coli str. clone D i2 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 298 10
Escherichia coli ABU 83972 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 318 8
Escherichia coli ABU 83972 plasmid pABU Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli BL21(DE3) Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 267 4
Escherichia coli BL21(DE3) Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 267 4
Escherichia coli DH1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 291 3
Escherichia coli DH1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 295 2
Escherichia coli B str. REL606 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 273 2
Escherichia coli ETEC H10407 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 306 15
Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p58 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 0
Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 4 1
Escherichia coli IHE3034 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 297 9
Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 295 3
Escherichia coli KO11FL Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 293 0
Escherichia coli KO11FL Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 301 1
Escherichia coli BW2952 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 278 5
Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli LF82 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 287 1
Escherichia coli NA114 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 295 8
Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 310 4
Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 3 0
Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_3 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 2 0
Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 1 2
Escherichia coli CFT073 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 311 5
Escherichia coli 536 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 312 2
Escherichia fergusonii ATCC 35469 plasmid pEFER Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 7 2
Escherichia fergusonii ATCC 35469 Bacteria / Proteobacteria / Gammaproteobacteria / Enterobacteriales / Enterobacteriaceae / Escherichia. / 272 2


Locations of visitors to this page
Date : 26 April 2024, 15:10:32 - Licence CeCILL-C (EN - FR)- Copyright/Mentions legales